Στη
συγκεκριμένη τοποθεσία υπήρχε ανέκαθεν ναός. Το 1668 όμως η παλιά εκκλησία
πυρπολήθηκε και έτσι ένας παπάς ονόματι Παπαγκίκας ανέλαβε μαζί με τον γιό του
Γεώργιο να ξαναχτίσουν έναν νέο ναό επάνω στα αποκαΐδια του παλιού. Αξίζει να
σημειωθεί ότι ο Άγιος Αθανάσιος είναι η δεύτερη παλαιότερη εκκλησία της Κοζάνης
μετά τον Άγιο Δημήτριο. Το 1880 γίνεται μεταφορά 1323 φορτίων πέτρας για την
περίφραξη της αυλής. Το 1885 τοποθετείται το τέμπλο καθώς και οι εικόνες. Σε
ένθετη μαρμάρινη επιγραφή στο εξωτερικό του ιερού βήματος αναφέρεται: Εις τον
νάρθηκαν και περίβολον του Αγίου Αθανασίου εγκατεστάθη και ελειτούργησε κατά
τους μήνας Μάιο και Σεπτέμβριο 1949 το Στρατηγείον Ηπείρου και Δ.Μακεδονίας το
οποίον διηύθυνε τας νικηφόρους επιχειρήσεις Βίτσι-Γράμμου. Από το 1980-1989
έγιναν νέες επισκευές. Κατασκευάσθηκε ο πρόναος, το κωδωνοστάσιο,
αποκαταστάθηκε η στέγη, εξωραΐστηκε και προστατεύθηκε ο περίβολος με την
πρωτοβουλία του εφημερίου Αποστόλου Μάστορα και των επιτρόπων. Το 1992 έγινε
γεώτρηση και βρέθηκε νερό καλής απόδοσης που χρησιμεύει στο πότισμα του κήπου.
Η αυλή αποτελεί πνεύμονα πρασίνου για την πόλη. Υπάρχουν πολλά δέντρα,
λουλούδια και έχει τοποθετηθεί γκαζόν με την πρωτοβουλία του εφημερίου Χαρισίου
Σπάρτακου, των επιτρόπων καθώς και με την βοήθεια της γειτονιάς. Το σημερινό
πάρκο γύρω από τον ναό ήταν έως το 1914 νεκροταφεία της Κοζάνης.
